產(chǎn)品及特點(diǎn)：
志賀氏菌屬(Shigella spp.)是一類革蘭陰性短小桿菌，是人類細(xì)菌性痢疾最為常見的病原菌，主要流行于發(fā)展中國家，通稱痢疾桿菌，耐寒，能在普通瓊脂培養(yǎng)基上經(jīng)過 24 小時生長，形成直徑達(dá) 2mm 大小、半透明的光滑型菌落。在腸道桿菌選擇性培養(yǎng)基上形成無色菌落。大小為 0.5~0.7×2~3μm，無芽胞，無莢膜，無鞭毛，多數(shù)有菌毛。革蘭氏陰性桿菌，是人和靈長類動物的腸道致病菌，引起細(xì)菌性痢疾。本公司開發(fā)志賀氏菌屬通用染料法熒光定量 PCR 試劑盒，它具有下列特點(diǎn)：
1. 即開即用，用戶只需要提供病毒樣品。
2. 根據(jù)志賀氏菌屬通用保守序列設(shè)計(jì)的專一性引物，與相關(guān)病毒無交叉反應(yīng)。
3. 靈敏度可以達(dá)到幾百拷貝/反應(yīng)。
4. 一管式熒光定量 PCR 檢測，避免后續(xù)污染。
5. 本試劑盒足夠 50 次 20μL 反應(yīng)體系的熒光定量 PCR。
規(guī)格及成分：
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編號
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成分
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規(guī)格
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試劑一
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2×qPCR MagicMix
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500 μL（棕色管）
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試劑二
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熒光 PCR 專用模板稀釋液
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1 mL（黃蓋）
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試劑三
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志賀氏菌屬通用染料法PCR 引物混合液
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100 μL（白蓋）
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試劑四
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志賀氏菌屬通用染料法PCR 陽性對
照(1×10E8 /μL)
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50 μL（紅蓋）
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試劑五
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DNA 病毒裂解液（試用裝）
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15 次（9 mL）
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使用手冊
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1 份
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運(yùn)輸及保存：
低溫運(yùn)輸、-20℃保存，有效期一年。
自備試劑：
DNA 模板、10×ROX（根據(jù)機(jī)型決定，具體見使用方法）。
使用方法：
一、稀釋PCR陽性對照（以10E2-10E7拷貝/μL這6 個 10倍稀釋度為例）：
1. 注意：由于標(biāo)準(zhǔn)品濃度非常高，因此下列稀釋操作一定要在獨(dú)立的區(qū)域進(jìn)行，千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分）。為增加產(chǎn)品穩(wěn)定性和避免擴(kuò)散傳染性病原，本產(chǎn)品不提供活體樣品做陽性對照，只提供可以直接使用的 DNA 片段作為陽性對照。
2. 標(biāo)記 6 個離心管，分別為 7，6，5，4，3，2。
3. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液（最好用帶芯槍頭，下同）。
4. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照，充分震蕩 1 分鐘，得1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
5. 換槍頭，在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得)，充分震蕩 1 分鐘，得 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
6. 換槍頭，在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照到 5 號管中，充分震蕩 1 分鐘，得 1×10E5 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
7. 重復(fù)上面的操作直到得到 6 個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。
二、樣品 DNA 的制備：
8. 如果有 N 個樣品，必須設(shè)置 N+2 個提取，多出的一個是 PC（樣品制備陽性對照），一個是 NC（樣品制備陰性對照）。可以用 10μL 上步制備的 PCR 陽性對照的第 4號（濃度為 1×10E4 拷貝/μL，10μL 相當(dāng)于 1 萬拷貝）或第 5 號（濃度為 1×10E5拷貝/μL，10μL 相當(dāng)于 10 萬拷貝）再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣，以此作為 PC。另外用水作為 NC。如果每次制備需要 200μL 樣品，則 PC 和 NC 的體積也必須是 200μL。
9. 用自選方法純化樣品的 DNA，本試劑盒跟市場上大多數(shù)病毒 DNA 提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的一管式病毒 DNAout 或其升級版柱式病毒 DNAout。本試劑盒免費(fèi)贈送 15 次一管式病毒 DNAout。
三、設(shè)置 qPCR 反應(yīng)（20 μL 體系，在樣品制備室進(jìn)行）：
10. 如果只做 1 次重復(fù)，則標(biāo)記 N+9 個 PCR 管，其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品，1 個用于 PCR 陰性對照，6 個用于 PCR 陽性對照。如果做 2-3 次重復(fù)，則反應(yīng)設(shè)置數(shù)量相應(yīng)增加 2 或 3 倍。
11. 在標(biāo)記管中按下表加入各成分（本表只列出一次重復(fù)。樣品管和陰性對照設(shè)置完畢后才設(shè)置陽性對照，并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后加）：
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成分
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樣品管 N+2 個
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PCR陰性對照管
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PCR陽性對照管2-7 管
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2×qPCR MagicMix （棕色管）
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10μL
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10 μL
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各 10 μL
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志賀氏菌屬通PCR引物混合液（白蓋）
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2 μL
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2 μL
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各2 μL
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自備 10×ROX (見注)
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2 μL
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2 μL
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各 2 μL
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N+2 待測樣品 DNA 模板
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6 μL
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不加
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不加
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第7步所得PCR陽性對照稀釋液2-7 號
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不加
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不加
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各6μL2號樣到2號管3號樣到3號管…
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注: 僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用 ROX 作為對照，其他熒光 PCR 儀器（如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480）不需要使用 ROX，則用水替代。
12.蓋上蓋子后上機(jī)，按下面參數(shù)進(jìn)行PCR（具體PCR參數(shù)可以根據(jù)儀器不同而自行優(yōu)化）。
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過程
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溫度
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時間
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預(yù)變性
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92℃
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5分鐘
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PCR反應(yīng)30個循環(huán)
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94℃
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60秒
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50℃
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60秒
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72℃
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60秒
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13. 數(shù)據(jù)采集
具體操作按所用儀器推薦的流程進(jìn)行。本產(chǎn)品中所含的熒光染料在不結(jié)合 DNA 時，最大吸收光譜在 471 nm，結(jié)合 DNA 時的最大吸收光譜在 500 nm，最大發(fā)射光譜在 530 nm。信號采集可以設(shè)置在復(fù)性或延伸步驟。
四、數(shù)據(jù)處理：
14. 如果把本試劑盒用于定量檢測，則以陽性對照濃度的 log 值為橫軸，以 Ct 值為縱軸，繪制標(biāo)準(zhǔn)曲線。再以待測樣品的 Ct 值從標(biāo)準(zhǔn)曲線上推算出樣品 DNA 濃度的log 值，再推算出其濃度。
15. 如果把本試劑盒用于定性檢測，只判斷陽性或陰性，則陰性對照 Ct 必須大于或等于 40。陽性對照必須有熒光對數(shù)增長，有典型擴(kuò)增曲線，Ct 值應(yīng)該小于或等于30。對待測樣品，如果其 Ct 大于或等于 40 則為陰性，如果小于或等于 35 則為陽性。如果在 35-40 之間，則重復(fù)一次。重復(fù)實(shí)驗(yàn)的 Ct 值如果大于或等于40則為陰性，如果小于40，則為陽性。
五、特別提示：
本公司的所有產(chǎn)品，僅可用于科研實(shí)驗(yàn)，嚴(yán)禁用于臨床醫(yī)療及其他非科研用途！
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