產品及特點：
節菱孢霉菌（Arthrinium spp.）簡稱節菱孢或節菱孢菌，是一類產毒霉菌，有 20 多個種，其中使甘蔗變質并產生有神經毒素的節菱孢霉菌主要是甘蔗節菱孢菌（Arthrinium sachari）、暗孢節菱孢菌（Arthrinium phaeospermum）和蔗生節菱孢菌（Arthrinium saccharicola）。其產生的毒素為 3-硝基丙酸，是一種耐熱性水溶性有毒物質，主要損害中樞神經系統。從某種意義上講，有甘蔗存在，就有節菱孢菌威脅人體健康的潛在危險存在，因此快速檢測節菱孢霉屬具有重要意義。熒光定量 PCR 是檢測病原的主流技術，本產品就是以染料法熒光定量 PCR 技術為基礎開發的專門檢測節菱孢霉屬的試劑盒，
1. 即開即用，用戶只需要提供病毒樣品。
2. 根據節菱孢霉屬通用保守序列設計的專一性引物，與相關病毒無交叉反應。
3. 靈敏度可以達到幾百拷貝/反應。
4. 一管式熒光定量 PCR 檢測，避免后續污染。
5. 本試劑盒足夠 50 次 20μL 反應體系的熒光定量 PCR。
規格及成分：
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編號
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成分
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規格
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試劑一
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2×qPCR MagicMix
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500 μL(棕色管)
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試劑二
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熒光 PCR 專用模板稀釋液
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1 mL(黃蓋)
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試劑三
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節菱孢霉屬通用染料法PCR 引物混合液
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100 μL(白蓋)
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試劑四
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節菱孢霉屬通用染料法PCR 陽性對照(1×10E8 /μL)
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50 μL(紅蓋)
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試劑五
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DNA 病毒裂解液(試用裝)
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15 次(9 mL)
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使用手冊
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1 份
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運輸及保存：
低溫運輸、-20℃保存，有效期一年。
自備試劑：
DNA模板、10×ROX(根據機型決定，具體見使用方法)。
使用方法：
一、稀釋PCR陽性對照(以10E2-10E7拷貝/μL這6個10倍稀釋度為例)：
1. 注意：由于標準品濃度非常高，因此下列稀釋操作一定要在獨立的區域進行，千萬不能污染樣品或本試劑盒的其他成分）。為增加產品穩定性和避免擴散傳染性病原，本產品不提供活體樣品做陽性對照，只提供可以直接使用的 DNA 片段作為陽性對照。
2. 標記 6 個離心管，分別為 7，6，5，4，3，2。
3. 用帶芯槍頭分別加入 45 μL 熒光 PCR 專用模板稀釋液（最好用帶芯槍頭，下同）。
4. 在 7 號管中加入 5 μL 1×10E8 拷貝/μL 的陽性對照，充分震蕩 1 分鐘，得1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
5. 換槍頭，在 6 號管中加入 5 μL 1×10E7 拷貝/μL 的陽性對照(上步稀釋所得)，充分震蕩 1 分鐘，得 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
6. 換槍頭，在 5 號管中加入 5 μL 1×10E6 拷貝/μL 的陽性對照到 5 號管中，充分震蕩 1 分鐘，得 1×10E5 拷貝/μL 的陽性對照。放冰上待用。
7. 重復上面的操作直到得到 6 個稀釋度的陽性對照。放冰上待用。
二、樣品DNA的制備：
8. 如果有 N 個樣品，必須設置 N+2 個提取，多出的一個是 PC（樣品制備陽性對照），一個是 NC（樣品制備陰性對照）。可以用 10μL 上步制備的 PCR 陽性對照的第 4號（濃度為 1×10E4 拷貝/μL，10μL 相當于 1 萬拷貝）或第 5 號（濃度為 1×10E5拷貝/μL，10μL 相當于 10 萬拷貝）再加上一定量的水使總體積跟每次制備要求的體積一樣，以此作為 PC。另外用水作為 NC。如果每次制備需要 200μL 樣品，則 PC 和 NC 的體積也必須是 200μL。
9.用自選方法純化樣品的 DNA，本試劑盒跟市場上大多數病毒 DNA 提取試劑盒兼容。也可以選購本公司的一管式病毒 DNAout 或其升級版柱式病毒 DNAout。本試劑盒免費贈送 15 次一管式病毒DNAout。
三、設置qPCR反應(20μL體系，在樣品制備室進行)：
10. 如果只做 1 次重復，則標記 N+9 個 PCR 管，其中 N+2 個用于上步得到的 N+2 個樣品，1 個用于 PCR 陰性對照，6 個用于 PCR 陽性對照。如果做 2-3 次重復，則反應設置數量相應增加 2 或 3 倍。
11. 在標記管中按下表加入各成分(本表只列出一次重復。樣品管和陰性對照設置完畢后才設置陽性對照，并且陽性對照樣品要等所有管子蓋上蓋子儲存好后最后加)：
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成分
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樣品管 N+2個
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PCR陰性對照管
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PCR陽性對照管(2-7管)
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2×qPCR MagicMix(棕色管)
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10μL
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10μL
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各10μL
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節菱孢霉屬通用PCR引物混合液(白蓋）
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2μL
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2μL
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各2μL
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自備10×ROX(見注)
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2μL
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2μL
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各2μL
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N+2待測樣品DNA模板
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6μL
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不加
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不加
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第7步所得PCR陽性對照稀釋液(2-7號)
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不加
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不加
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各6μL2號樣到2號管,3號樣到3號管
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注: 僅 ABI7500、7700 和 7900 儀器需要使用 ROX 作為對照，其他熒光 PCR 儀器（如 iCycler IQ、MJ Option、MJ Chromo4、MX3000、MX4000、RotorGene3000、RotorGene 6000 和 LightCycler480）不需要使用 ROX，則用水替代。
12.蓋上蓋子后上機，按下面參數進行PCR(具體PCR參數可以根據儀器不同而自行優化)。
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過程
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溫度
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時間
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預變性
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92℃
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5分鐘
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PCR反應30個循環
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94℃
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60秒
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50℃
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60秒
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72℃
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60秒
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13.數據采集
具體操作按所用儀器推薦的流程進行。本產品中所含的熒光染料在不結合DNA時，最大吸收光譜在471nm，結合DNA時的最大吸收光譜在500nm，最大發射光譜在530nm。信號采集可以設置在復性或延伸步驟。
四、數據處理：
14. 如果把本試劑盒用于定量檢測，則以陽性對照濃度的log值為橫軸，以Ct值為縱軸，繪制標準曲線。再以待測樣品的Ct值從標準曲線上推算出樣品DNA濃度的log值，再推算出其濃度。
15. 如果把本試劑盒用于定性檢測，只判斷陽性或陰性，則陰性對照Ct必須大于或等于40。陽性對照必須有熒光對數增長，有典型擴增曲線，Ct值應該小于或等于30。對待測樣品，如果其Ct大于或等于40則為陰性，如果小于或等于35則為陽性。如果在35-40之間，則重復一次。重復實驗的Ct值如果大于或等于40則為陰性，如果小于40，則為陽性。
五、特別提示：
本公司的所有產品，僅可用于科研實驗，嚴禁用于臨床醫療及其他非科研用途！
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